El profesor Bacterio ha inventado una flauta mágica: quien la hace sonar pierde la solidez y se convierte en un cuerpo etéreo. Mortadelo y el profesor Bacterio ya la han hecho sonar, y pronto descubren su capacidad para evitar golpes, traspasar paredes... Pero un agente enemigo se cuela en la organización y les roba la flauta, por lo que los agentes deberán recuperarla cuanto antes.